وی سومین و کوچکترین پسر رهبر سابق کره شمالی؛ کیم جونگ ایل است که به عنوان سومین نسل از خانواده، رهبری کره شمالی را در دست گرفت.
برادر بزرگتر وی کیم جونگ چول نام دارد که در سال ۱۹۸۱ به دنیا آمد. وی همچنین برادر ناتنی دیگری دارد با نام کیم جونگ نام که او در سال ۱۹۷۱ به دنیا آمد.
اما کیم جونگ ایل وی را به عنوان جانشین خود انتخاب کرده بود و در سال ۲۰۱۱ پس از درگذشتش، کیم جونگ اون رهبر کره شمالی شد.
کیم جونگ ایل نیز در سال ۱۹۹۴ پس از مرگ کیم ایل سونگ که رئیس جمهور و بنیانگذار کره شمالی بود، لقب رئیس جمهور ابدی را به خود گرفت.
وی به طور رسمی در سال ۱۹۹۷ به عنوان دبیر کل حزب کمونیست کارگران کره شمالی و رئیس شورای ملی دفاع انتخاب شد.